廈門理工大學應該是廈門理工學院，該校還沒有升格為大學。廈門理工學院是廈門市屬的綜合性大學。福建工程學院位于福州，是福建省屬高校，也是博士學位立項建設高校。兩所高校的比較可以通過如下幾個方面進行：

第一，綜合實力從綜合實力來看，廈門理工學院前幾年長期徘徊在全國400位開外，這兩年廈門市政府投入較大，排名有所提升，目前跨過400名，進入了300多位；福建工程學院的排名稍微比廈門理工學院好一點點，也是300多位?？傮w上，福建工程學院稍微好點。

第二，學科建設福建工程學院目前擁有1個福建省特色重點學科、5個福建省一級重點學科、9個福建省二級重點學科、3個學術學位一級學科碩士點、2個專業(yè)學位授權類別、2個專業(yè)學位授權領域。

廈門理工學院有擁有省級重點學科5個：機械工程、材料科學與工程、電氣工程、光學工程、計算機科學與技術 ；碩士學位授權一級學科：機械工程、管理科學與工程。

學科建設方面，福建工程學院稍微好點。

第三，專業(yè)建設福建工程學院擁有國家級實驗教學示范中心1個、國家級虛擬仿真實驗教學中心1個、國家級特色專業(yè)3個、國家級本科高校專業(yè)綜合改革試點專業(yè)1個、國家級精品資源共享課程2門，獲得國家高等教育教學成果二等獎（2014年）1項。

廈門理工學院有國家級特色專業(yè)1個，國家級綜合改革試點專業(yè)1個，省級特色專業(yè)9個，省級綜合改革試點專業(yè)7個，國家“卓越工程師教育培養(yǎng)計劃”實施專業(yè)5個，省級“卓越工程師教育培養(yǎng)計劃”實施專業(yè)6個，省級人才培養(yǎng)模式創(chuàng)新實驗區(qū)9個，省級精品課程29門，省級教學改革試點項目17項，國家級大學生創(chuàng)新訓練項目144項，省級大學生創(chuàng)新訓練項目265個。

從高級別教學建設項目來看，福建工程學院還是稍微好點。